Formations
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Du mardi 17/05/2022 au mercredi 18/05/2022 - Du mardi 15/11/2022 au mercredi 16/11/2022
- Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
- Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques -
Du mardi 19/05/2022 au mercredi 20/05/2022 - Du jeudi 17/11/2022 au vendredi 18/11/2022
- Savoir analyser des séquences venant de reads NGS
- Savoir déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés à l'aide de données RNA-seq
- Etre capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de connaissance -
Du 14/06/2022 au 17/06/2022 - Du 06/12/2022 au 09/12/2022
-Savoir mener des analyses standards en bioinformatique avec Python et Biopython
-Accéder à l'information disponible dans les ressources en ligne à partir d'un script Python
-Être capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de données
-Apprendre à se servir des librairies Python pour présenter graphiquement ses résultats -
Du mardi 13/10/2020 au jeudi 15/10/2020 - Du mardi 04/05/2021 au jeudi 06/05/2021 - Du mardi 19/10/2021 au jeudi 21/10/2021
- Savoir rechercher des informations dans les banques de données.
- Maitriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats.
- Maitriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens.
- Maitriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS).
Ateliers
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Le but de ces ateliers est de permettre d’appréhender les projets scientifiques ayant trait au séquençage de façon globale allant de la production de données à leur analyse. Ils concernent aussi bien les chercheurs, les personnels techniques que les étudiants présents dans les laboratoires.
Les ateliers vont vous permettre de :- Connaître les spécificités des différentes technologies de séquençage et savoir laquelle est la mieux adaptée à vos besoins
- Réfléchir au schéma expérimental (nombre d’échantillons, profondeur de lecture et qualité de séquençage)
- Connaître les principales méthodes de préparation de librairies, leurs avantages et leurs inconvénients
- Connaître les éléments permettant de planifier une expérience NGS
- Connaitre les limites d’analyse : que puis-je obtenir en fonction de mes données ? A quelle question biologique pourrais-je répondre en fonction des méthodes bioinformatiques et des caractéristiques des données obtenues ?
Les ateliers Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 » traiteront de 4 sujets :
- RNA-Seq, 22 avril 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations.
- Génome complet, 3 mai 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
- Exomes et panels de gènes, 20 septembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
- Métagénomique, 7 novembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
Attention : INSCRIPTION GRATUITE MAIS OBLIGATOIRE
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