Formations
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Du mardi 26/05/2020 au mercredi 27/05/2020 ou du mardi 01/12/2020 au mercredi 02/12/2020
Plus de détails- Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
- Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques -
Du jeudi 28/05/2020 au vendredi 29/05/2020 ou du jeudi 03/12/2020 au vendredi 04/12/2020
Plus de détails- Savoir analyser des séquences venant de reads NGS
- Savoir déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés à l'aide de données RNA-seq
- Etre capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de connaissance -
du mardi 05/05/2020 au jeudi 07/05/2020 ou du mardi 13/10/2020 au jeudi 15/10/2020
Plus de détails- Savoir rechercher des informations dans les banques de données.
- Maitriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats.
- Maitriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens.
- Maitriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS).
Ateliers
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Le but de ces ateliers est de permettre d’appréhender les projets scientifiques ayant trait au séquençage de façon globale allant de la production de données à leur analyse. Ils concernent aussi bien les chercheurs, les personnels techniques que les étudiants présents dans les laboratoires.
Les ateliers vont vous permettre de :- Connaître les spécificités des différentes technologies de séquençage et savoir laquelle est la mieux adaptée à vos besoins
- Réfléchir au schéma expérimental (nombre d’échantillons, profondeur de lecture et qualité de séquençage)
- Connaître les principales méthodes de préparation de librairies, leurs avantages et leurs inconvénients
- Connaître les éléments permettant de planifier une expérience NGS
- Connaitre les limites d’analyse : que puis-je obtenir en fonction de mes données ? A quelle question biologique pourrais-je répondre en fonction des méthodes bioinformatiques et des caractéristiques des données obtenues ?
Les ateliers Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 » traiteront de 4 sujets :
- RNA-Seq, 22 avril 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations.
- Génome complet, 3 mai 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
- Exomes et panels de gènes, 20 septembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
- Métagénomique, 7 novembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
Attention : INSCRIPTION GRATUITE MAIS OBLIGATOIRE
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