Formations

  • Du mardi 01/12/2020 au mercredi 02/12/2020 -  Du mardi 18/05/2021 au mercredi 19/05/2021 - Du mardi 02/11/2021 au mercredi 03/11/2021

    3. Bioinformatique : Langage R - introduction

    - Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
    - Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques

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  • Du mardi 02/02/2020 au mercredi 03/02/2020 - Du jeudi 20/05/2021 au vendredi 21/05/2021 - Du jeudi 04/11/2021 au vendredi 05/11/2021

    4. Bioinformatique : Analyses NGS avec R

    - Savoir analyser des séquences venant de reads NGS
    - Savoir déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés à l'aide de données RNA-seq
    - Etre capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de connaissance

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  • Du 17/11/2020 au 20/11/2020 - Du 08/06/2021 au 11/06/2021 - Du 16/11/2021 au 19/11/2021

    2. Analyses bioinformatiques avec Python

    -Savoir mener des analyses standards en bioinformatique avec Python et Biopython
    -Accéder à l'information disponible dans les ressources en ligne à partir d'un script Python
    -Être capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de données
    -Apprendre à se servir des librairies Python pour présenter graphiquement ses résultats

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  • Du mardi 13/10/2020 au jeudi 15/10/2020 - Du mardi 04/05/2021 au jeudi 06/05/2021 - Du mardi 19/10/2021 au jeudi 21/10/2021

    1. Bioinformatique : Analyse avancée de séquences

    • Savoir rechercher des informations dans les banques de données.
    • Maitriser les outils d'analyse de séquences tels que les alignements et savoir interpréter les résultats.
    • Maitriser les stratégies d'annotation de génomes bactériens.
    • Maitriser les formats et les analyses des nouvelles données issues du séquençage (NGS).

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Ateliers

  • Ateliers « 2 en 1 » : Production et Analyses de données NGS

    Le but de ces ateliers est de permettre d’appréhender les projets scientifiques ayant trait au séquençage de façon globale allant de la production de données à leur analyse. Ils concernent aussi bien les chercheurs, les personnels techniques que les étudiants présents dans les laboratoires.
    Les ateliers vont vous permettre de :

    • Connaître les spécificités des différentes technologies de séquençage et savoir laquelle est la mieux adaptée à vos besoins
    • Réfléchir au schéma expérimental (nombre d’échantillons, profondeur de lecture et qualité de séquençage)
    • Connaître les principales méthodes de préparation de librairies, leurs avantages et leurs inconvénients
    • Connaître les éléments permettant de planifier une expérience NGS
    • Connaitre les limites d’analyse : que puis-je obtenir en fonction de mes données ? A quelle question biologique pourrais-je répondre en fonction des méthodes bioinformatiques et des caractéristiques des données obtenues ?

    Les ateliers Génomique / Bioinformatique « 2 en 1 » traiteront de 4 sujets :

    1. RNA-Seq, 22 avril 2016 :  Retrouvez ici les vidéos des présentations.
    2. Génome complet, 3 mai 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
    3. Exomes et panels de gènes, 20 septembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations
    4. Métagénomique, 7 novembre 2016 : Retrouvez ici les vidéos des présentations

    Attention : INSCRIPTION GRATUITE MAIS OBLIGATOIRE

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