3. Bioinformatique : Langage R - introduction

Dates

Du mardi 17/05/2022 au mercredi 18/05/2022 -  Du mardi 15/11/2022 au mercredi 16/11/2022


Intervenants

Aurélien Barré, Benjamin Dartigues


Lien de la formation


Objectifs

- Acquérir les bases pour l'utilisation du langage R
- Savoir manipuler et visualiser grands ensembles de données biologiques


Programme

  Cette formation introduira le langage R et les techniques de fouille et de visualisation de données.

- Installation et configuration de R
- Notions et commandes essentielles (variables, fonctions ?)
- Les formats de fichiers, la lecture et l'écriture de données tabulées
- Les outils de manipulation et de transformation de grands tableaux
- Les constructions modernes pour la création de graphiques

Alternance de courtes présentations (50 % du temps) suivies de travaux pratiques basés sur des jeux de données réels (50 % du temps).

Ce stage pourra être poursuivi par un stage consacré à l'analyse NGS avec R (Réf. 18339, ce catalogue).


Prérequis

Notions de base en informatique (gestion de fichiers, navigateur web, etc.)


Public

 Ingénieurs, techniciens biologistes ou bioinformaticiens de formation