Présentation

L’équipe du Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) intervient à la frontière entre les sciences du vivant et l'informatique - statistique. Sa spécialité est la collecte, l'intégration, le croisement et l'analyse des données "omics". L'exigence d’analyser les données de grande volumétrie de façon rapide et fiable, amène le CBiB à développer les méthodes de type « Big Data ». Pour ce faire, le CBiB réunit les compétences nécessaires en bioinformatique et en informatique ; le centre est équipé de moyens de calcul et stockage adaptés, en cohérence avec les équipements régionaux (le Mésocentre de Calcul Aquitain - MCIA), l’infrastructure nationale de Bioinformatique (Investissement d’Avenir, Institut Français de Bioinformatique - IFB) et l'Infrastructure Européenne ELIXIR.

En termes d’offre de services, le CBiB propose une large palette de prestations :

  • analyse et intégration de données "omics",
  • développement d’analyses spécifiques,
  • développement de pipelines et méthodes bioinformatiques.

Son expertise est particulièrement reconnue en algorithmique, intégration de données biologiques à haut débit, leur analyse et visualisation. Que ce soit dans des grands projets ou encore pour des expertises particulières l'équipe possède l'expertise, les équipements et la capacité d'étudier la complexité des systèmes biologiques.

Les services proposés par le CBiB sont les suivants :

  • Analyses standards et à facon de données biologiques.
  • Mise en place d'approches "Big Data".
  • Développement et maintenance de bases de données biologiques.
  • Développement de l'infrastructure et de logiciels bioinformatiques, en particulier pour les données de NGS.
  • Analyse et conseils personnalisés pour des projets de bioinformatiques.
  • Mise en place de projets collaboratifs avec des équipes de recherches. 
  • Ateliers et formations sur différentes thématiques de bioinformatique.